木本植物有86科270属665种，其中裸子植物8科23属38种，被子植物双子叶75科234属588种、单子叶3科13属39种。

用材类树种　主要有杉木、柳杉、马尾松、黄山松、湿地松、火炬松、柏木、日本扁柏、檫木、泡桐、四川桤木、枫香、木荷、苦槠、南酸枣、青钱柳、香樟、光皮桦、银杏、响叶杨、天台水青冈、绵槠、糙叶树、芽朴、沙朴、杭州榆、榉树、玉兰、山合欢、花榈木、黄檀、香椿、黄连木、南京椴、山桐子、蓝果树、刺楸、香果树等。

经济类树种　主要有菝葜、乌桕、油桐、豹皮樟、红楠、浙江新木姜子、紫楠、南方红豆杉、榧、黄连木、漆树、野漆树、葡蟠、青桐、野葛、棕榈、紫穗槐、银荆、豆腐柴、山茱萸等。

观赏类树种　主要有雪松、黑松、华山松、日本五针松、柳杉、柏木、龙柏、日本花柏、罗汉松、竹柏、荷花玉兰、香樟、女贞、桂花、山茶、棕榈、石楠、银杏、金钱松、水杉、池杉、落羽杉、四川桤木、糙叶树、白榆、榔榆、枫杨、辛夷、玉兰、鹅掌楸、悬铃木、槐、合欢、乌桕、青榨槭、鸡爪槭、七叶树、无患子、南酸枣、重阳木、喜树、苦楝、青桐、樱桃、梅、桃、李、紫微、垂柳、杨树、南京椴、苏铁、含笑、南天竹、月桂、月季、胡颓子、黄杨、正木、茉莉、夹竹桃、█木、栀子、牡丹、腊梅、贴梗木瓜、棣棠、玫瑰、紫荆、木槿、小檗、宁波溲疏、伞形绣球、腊瓣花、黄栌、雀梅藤、结香、映山红、雪柳、老鸦柿、金钟花、薜荔、紫藤、爬山虎、常青藤、络石、凌霄、南蛇藤、金银花等。

竹类用材类　有毛竹、雷竹、角竹、水竹、黄古竹、青皮竹、绿皮黄筋竹等；笋用类有雷竹、角竹、红壳竹、紫竹、胖竹等；观赏类有方竹、紫竹、凤尾竹、罗汉竹、观音竹(孝顺竹)、龟甲竹等。

药用植物　有459种，分隶于111科，其中裸子植物8种，被子植物(双子叶和单子叶)420种，蕨类23种，菌类8种。以根或根茎入药的有白术、乌药、半夏、草乌、何首乌、三七、香附、地榆、前胡、丹参、党参、橘梗、七叶一支花、粉草藓等；以叶入药的有淡竹叶、侧柏叶、桑叶、石楠叶、紫苏叶、荷叶等；以花入药的有金银花、野菊花、夏枯球、望春花、小春花、月季花、木槿花等；以果实入药的有山楂、山栀、米仁、青皮、女贞子、杏仁、桃仁、苏子、覆盆子等；以全草入药的有鱼腥草、半枝莲、垂盆草、益母草、鹅不食草、半边莲、连钱草等；以藤本入药的有夜交藤、忍冬藤、络石藤、青枫藤、天仙藤、勾藤、鸟不宿等；以皮入药的有紫金皮、杜仲、厚朴、黄柏、黄瓜皮等；以菌类人药的有茯苓、灵芝、银耳、天麻、竹荪等。

珍稀树种根据国务院环境保护委员会1984年公布的第一批《中国珍稀濒危保护植物名录》，境内被列为国家重点保护的珍稀树种有14种，分属一、二、三级。

一级保护的有水杉，属杉科，是世界上珍稀的孑遗植物，有“活化石”之称，系60年代栽植。 ．

二级保护的8种：银杏，属银杏科，是现存种子植物中最古老的孑遗植物，系人工栽培；金钱松，属松科，濒危种，材质优良，华顶雪坑有高20米，胸径50公分的大金钱松5株；水松，属杉科，是古老的残存种，集云乡龙皇堂有l株，系60年代栽植；夏蜡梅，属蜡梅科，是东亚和北美的间断分布种，岭里乡有自然生长；香果树，属茜草科，中国特有的单种属植物，华顶山天兴庵有生长；浙江七子花，属忍冬科，中国独有种，华顶山有独特群落；浙江樟，属樟科，起源古老，是独特珍贵用材树种，方广有生长；鹅掌楸，属木兰科，起源古老的残存种，华顶林场60年代栽植。

三级保护的5种：厚朴，属木兰科，中原始种，贵重药材，大同林场有栽植；凹叶厚朴，属木兰科，贵重药材，华顶山有生长；短穗竹，属禾本科，稀有种，是中国特有的单种属植物，人工栽培；银钟花，属野茉莉科，天柱山有自然生长。

其他尚未落实保护等级的珍稀树种有青钱柳、榧、三尖杉、南方红豆杉、天台鹅耳枥，天台水青冈、紫茎、天目紫茎、杜仲、云锦杜鹃、蓝果树、莽草、光皮桦、花榈木、玉兰、糙叶树、长果桂、南酸枣等。