建国以前，海门港口内曾有可供吃水6米以下的20艘船舶停泊的锚地，江边卫一带水域为沿海木帆船停泊处，内江小帆船多半停靠在石砌道头边。建国以后，随着船舶来港密度的增加和吨位的加大，对船舶锚地曾作多次划分、调整和扩大。70年代曾划小园山附近为大型机动船锚地，前所以南为机动船锚地，7号码头以西的沿海为大帆船锚地、危险品锚地，以及三江口一带为船舶避风锚地等。1978年以后，对国轮外贸运输船舶和外国籍船舶开放，海门港针对国际航行船舶的大型化，要求有相适应的深水驳载锚地和航道等情况，划定了引航检疫锚地、驳载锚地和引航检疫锚地的航道。

划定的第一引航、检疫锚地为点灯山锚地，位于头门山南面1海里处，水域面积约610万平方米，水深8～8．6米，可避北风8～9级，供4～5艘3000吨级以上船舶锚泊；第二引航、检疫锚地为大陈锚地，位于上、下大陈岛之间，水域面积116万平方米，水深12～14米，可避东北风外的诸风向，供1～2艘万吨级以上船舶锚泊。

划定的点灯山驳载锚地，位于头门山西南约1海里处，水域面积约292万平方米，水深8．4～9．2米，可避北-东北风8～9级，驳载风力6～7级，供2艘3000吨级以上船舶驳载；大麦屿驳载锚地，位于乐清湾，水域水深12～20米，可避台风及诸风向，距海门约72海里；三门湾驳载锚地，位于三门湾，水域水深12～15米，可避东南、东风外的诸风向，距海门港约60海里。

划定进出第一引航检疫锚地的航道在东矶灯桩正南约4．77海里处（即东经121°56′08″、北纬28°38′35″）至大茶花灯桩连线南、北各500米以及小茶花与凉帽屿之间的水域；进出第二引航检疫锚地的航道在东经121°55′30″、北纬28°29′13″与东经121°52′50″、北纬28°27′35″两点的连线南、北各250米的水域，即孔横山与固定礁连线以南330米以外及小鸡头与小礁头连线以北370米以外的水域。