台州植物区系以东亚区系华东地区成分为主，与华中、华南、西南等地区有亲缘关系，与南亚区系也有某种联系，亚热带、热带、温带植物兼有。全区有藏类植物40余科、200多种，硅藻植物120多种，种子植物近150科、1660多种，其中木本植物91科、320属、881种。有内陆珍稀濒危植物80多种，列为国家级保护者15种。其中国家二级保护植物有夏腊梅（Calycanthuschinensis cheng et S·Y·chang）、香果树（Emmenopterys henryi oliv）、福建柏（Fokienia hodginsii）Henry et Thomas）、银杏（Ginkgo biloba linn）、浙江七子花（Heptacodium Jasmi-noides Airy一shaw）、鹅掌揪（Liriodendron Chinense·>Sarg）、金钱松（Pseudolarix amabilis Rehd）、长叶榧树（Torreya Jackii chun）、钟萼木（Bretschne idera sinensis）；国家三级保护植物有银钟树（Halesia macgregoriichun）、天目木姜子（Litsea auauriculata chien et cheng）、黄山木兰（Magnolia cylin-drica wils）、凹叶厚朴（Magnolia officinalis subsp biloba·et wits>cheng etlaw）、半枫荷（Semiliguidambar cathayensis.H·T·chang）、紫茎（Stewartia sinensisRehd et Wils）。列为地区保护的特有稀有树种还有天台大叶械、天台槐蓝、天台鹅耳枥、云锦杜鹃、黄山紫荆，、南方红豆杉、榧树、竹柏、三尖杉、华东楠、蓝果树、青钱柳、山拐枣、浙江樟等。长叶榧于民国13年（1924）在仙居县城南首次发现，由金陵大学教授秦仁昌采集标本，中国树木分类学专家陈焕镛定名，列入《中国植物模式标本》（编号：1179）。

1990年开始的海岛植被资源调查发现，创中国分布新纪录的有冬青卫茅（Eu-onymus japonicus Thunb）、绢毛萱麻（Boehmeria holosericea BL.aff）、田野水苏（Stachys arVensis L.）、日本黄菫（Corydalis heterocarpa var japonicaohwi）,阔叶沿阶草（Ophiopogonj aburanLodd）、北美水茄（Solanum Carolinense L.）、日本荚莲（Viburnum japonicum spreng）；创中国大陆分布新纪录的有裂叶假还阳参（Crepidiastrum,LanceolaturmNakai）滨海苔草（carex wahuensisC.A. Mey.subsp.robusta T. koyama）；创浙江分布新纪录的有台湾景天（S.formosanum N.E.Brown）、毛柱郁李（P.Pogonostyla Maxim)、萝性千斤拔（Flemingia philippinesis Merr.et Rolfe）、倒卵算盘子（Glochidion obo-vatum Sieb. et Zucc）、台湾虎尾草（Chloris formosana keng）、心萼薯（Aniseia biflora <(L.>choisy）、海滨白戍草（Leucas chinensis R. Br）、小叶黄花稔（Sida alnifolia L. Var. microphylla S. Y. Hu）等。有滨海或海岛特有植物84种，已列国家级保护的珍稀濒危植物有：全缘冬青（Liex integraThunb）、野大豆（glycine soja sieb. et zucc）；列省级保护的有厚叶石斑木（Raphi-olepis umbellatamakino）、龙须藤（Bauhinia championiiBenth）、亮叶猴耳环（Pithecellobium Lucidum Benth）、蔓九节（Psychotria SerPens L.）、多枝紫金牛（Ardisia Sieboldii Mig）。

在野生植物中，有用材类、果菜类、淀粉类、油料类、纤维类、饲料类及化工原料等植物资源800多种，药用植物资源948种，观赏植物200多种。

用材类 主要有杉木、柏木、香樟、马尾松、湿地松、苦楝、檫木、麻栎、枫香、泡桐、木荷、苦槠、银杏、香椿、黄檀、沙朴、榆树、榉树、桤木、水杉、水青冈、花榈木、响叶杨、黄连木、蓝果树、香果树、柳杉等60多种树木及楠竹、水竹、雷竹、角竹、青皮竹、黄古竹、紫竹等竹类。

果菜类 有猕猴桃、金樱子、山棠梨、薛荔果、香榧、银杏、板栗、樱桃、青梅、杨梅、桃、李、枣和荸荠、荷莲、蕨菜、刺苋、荠菜、紫菜、海带、浒苔、马兰、马齿苋、石花菜等采集品种60余种。

淀粉类 有松花、葛根、蕨根、百合、茯苓、魔芋、菝葜、茅栗、苦槠、绵槠、麻栎、白栎、黄狗子、菱、藕等50多种。

油料类 有樟树子、山胡椒子、油茶、油桐、乌柏等果实油脂类资源50多种，有山苍子、红楠、香樟、细叶香桂、薄荷、紫苏、香根草、樟树、茉莉、留兰香以及芸香科植物等芳香油原料30多种。

纤维类 有咸草、龙须草、芒杆、剑麻、山油麻、野苎麻、咸青皮、楠竹壳、黄荆条、山棉皮、木榧、紫藤、桑树、糙叶、天仙果、野葛、田菁、网络崖豆藤、木槿、毛竹、四季竹、青皮竹、棕榈、芦苇、千金藤等编织、造纸原料50多种。

饲料类 主要有牛筋草、紫云英、马唐、狗尾草、狗牙根、雀稗、葛藤、野绿豆、野豌豆、野扁豆、猪秧秧、空心莲子草、千金子、牛繁缕、鸭跖草、细柄草、蔊菜、北美独行菜、假酸浆、荩草、野古草、鸡眼草、中华胡枝子、水浮莲、绿萍等饲草及硅藻饲料138种。

化工原料 有闹羊花、醉鱼草、辣蓼、大戟、雷公藤、蓖麻等农用、药用原料39种，以及银荆、黑荆、化香、皂荚、枫树、柃木、黄连木、臭辣树、过山枫、罗浮柿、薯莨、榆树皮、棕榈子等其他化工原料50多种。

中药材 据统计，全区共有中药材1279种，为浙江省中药材主要产区之一。其中野生植物类有松萝、鸟药、黄连、何首乌、蛇足草、阴地蕨、山荷叶、石吊兰、海风藤、天葵子、板蓝根、仙鹤草、七叶一枝花、白花蛇叶草、车前草、夏枯草、百合、马兰、积雪草、一枝黄花、香附子、杠板归、半夏、白芨、桔梗、忍冬、单叶蔓荆、广州石仙桃等948种。珍稀药材有浙黄连、竹节参、龙胆草、石槲、天冬、杜仲、凹叶厚朴、三尖杉等。从1961年开始，台州先后有73种野生中药材被列入国家收购计划，最高年收购量达2350吨。年收购量在25吨以上的有前胡、山楂、槲蕨、青皮、乌药、黄精、野菊花、覆盆子、夏枯草、石菖蒲、白茅根、淡竹叶、香附子等。天台乌药、仙居丹参、温岭荆芥及枫茄花为出口药材。

观赏植物 有香花类的山兰、桂花、腊梅、桅子花、厚朴、金银花、换锦花、水仙、茉莉、深山含笑及观花类的云锦杜鹃、金雀花、映山红、六月雪、美人蕉、山茶、紫薇、紫荆、月季等，共50多种；观果类有金豆、菩提、枸杞、胡颓子、悬铃木、南天竹、铁冬青等20多种；观木类有雀梅、竹柏、黄杨、海桐、滨柃、厚叶石斑木、毛柱郁李、全缘冬青、圆叶景天、过山枫、多枝紫金牛、亮叶猴耳环、金钱松、凤尾草等30余种；攀缘类有紫藤、钩藤、鸡血藤、千金藤、爬山虎、威灵仙等30多种；观杆类有云竹、紫竹、斑竹、观音竹等10余种；庭荫类有罗汉松、龙柏、凤尾柏、木槿、杜英、合欢、冬青、棕榈、花榈木、黄连木等100多种。